Nach dem Start des Setup-Programms meldet sich ein Willkommendialog, in dem einige Hinweise gegeben werden und dann das Verzeichnis erfragt wird, in das JoJoThumb installiert werden soll.
Als Speicherort von JoJoThumb wird im Standardprogrammverzeichnis ein Unterverzeichnis mit dem Namen JoJoThumb vorgeschlagen.

Dieses Verzeichnis dient als Speicherort für JoJoThumb, die JoJoThumb-Hilfe und JoJoThumbIS30.DLL, dem Verzeichnis "profiles", in dem die Profile von JoJoThumb sowie dem Verzeichnis "deco", in dem mitgelieferte Deko-Quellverzeichnisse mit ihren Deko-Elementen abgelegt werden.
Wird ein anderer Speicherort gewünscht, kann dieser in der Verzeichnisauswahl eingestellt werden.

Anschließend wird als Eintrag im Startmenü JoJoThumb in der Programmgruppe JoJoSoftware vorgeschlagen.

Nach der Wahl der Programmgruppe kann die Installation gestartet werden. Sie erzeugt die Dateien bzw. Einträge mit den vorher gemachten Angaben sowie eine De-Installationsmöglichkeit, die über die Systemsteuerung, Komponente Software, verfügbar ist.